La Liga de Campeones de la EHF 2009-10 es la 50.ª edición de la competición. Arrancó en septiembre de 2009 y concluyó a finales de mayo de 2010. La final a 4 se jugó en Lanxess Arena de Colonia el 29 y 30 de mayo.
Ronda de clasificación
Está compuesta por tres grupos de cuatro equipos cada uno y dos grupos de cuatro equipos, el ganador de cada grupo tiene una plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2010-11. No hay partido de vuelta, puesto que se celebra en una ciudad cada grupo.
Grupo 1
Se celebró en la ciudad Macedonia de Skopje del 4 al 6 de septiembre. En donde el HC Vardar PRO - Skopje de Eslovaquia consiguió una plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2009-10
Grupo 2
Se celebró en la ciudad griega de Thessaloniki del 4 al 6 de septiembre. En donde el A.C. PAOK de Grecia consiguió la plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2009-10
Grupo 3
Se celebró en la ciudad noruega de Bergen del 4 al 6 de septiembre. En donde el Fyllingen Handball de Alemania consiguió una plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2009-10.
Grupo 4
Se celebró en la ciudad polaca de Kielce del 4 al 6 de septiembre. En donde el KS Vive Targi Kielce de Polonia consiguió la plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2009-10
Grupo W
Se celebró en la ciudad española de León del 4 al 6 de septiembre. En donde el Ademar de León de España consiguió una plaza para la Liga de Campeones de la EHF 2009-10
Fase de grupos
Esta fase está formada por 4 liguillas con 6 equipos cada una. Los cuatro primeros que se clasifiquen pasan a los octavos de final.
Grupo A
Está compuesto por el Montpellier Agglomération Handball francés, el Chejovskie Medvedi ruso, el BM Valladolid español, el HCM Constanta rumano, el SC Pick Szeged húngaro, y finalmente el A.C. PAOK. Se clasificaron el francés, el ruso, el español y el rumano para la siguiente ronda.
Grupo B
Está compuesto por el Veszprém KC húngaro, el Rhein-Neckar Löwen alemán, el KS Vive Targi Kielce polaco, el RK Velenje esloveno, el Chambéry Savoie Handball francés, y finalmente el Bosna Sarajevo bosnio. Se clasificaron el húngaro, el alemán, el polaco, el esloveno, el francés y el bosnio para la siguiente ronda.
Grupo C
Está compuesto por el BM Ciudad Real español, el HSV Hamburg alemán, el HC Croatia Osiguranje-Zagreb croata, el FCK Handbold A/S danés, el Alingsås HK sueco, y finalmente el Fyllingen Håndball noruego. Se clasificaron el español, el alemán, el croata, y el danés para la siguiente ronda.
Grupo D
Está compuesto por el Club Balonmano Ciudad Real español, el SG Flensburg-Handewitt alemán, el RK Zagreb croata, el Bosna Sarajevo bosnio, el St. Petersburg HC ruso, y finalmente el HCM Constanta rumano. Se clasificaron el español, el alemán, el croata, y el bosnio para la siguiente ronda.
Segunda fase
Octavos de final
Kadetten Schaffhausen - Montpellier Agglomération Handball
RK Zagreb - Rhein-Neckar Löwen
FC Barcelona Borges - Veszprém KC
KIF Kolding - THW Kiel
HSV Hamburg - Cuatro Rayas Valladolid
Bosna Sarajevo - Chejovskie Medvedi
SC Pick Szeged - SG Flensburg-Handewitt
Chambéry Savoie Handball - BM Ciudad Real
Cuartos de final
Chejovskie Medvedi - Montpellier HB
FC Barcelona Borges - Veszprém KC
Rhein-Neckar Löwen - THW Kiel
HSV Hamburg - BM Ciudad Real
Final4
Semifinales
Chekhovskie Medvedi - FC Barcelona Borges
BM Ciudad Real - THW Kiel
3º y 4º puesto
Final
